NVIDIA、タンパク質設計AI「RFD4」を公開

米NVIDIAは2026年10月21日、ドイツ・ベルリンで開催された「GTC Berlin」において、ワシントン大学医学部タンパク質設計研究所（IPD）との共同開発によるオープンモデル「RFD4-Proteina（NVIDIAとワシントン大学が開発したタンパク質設計オープンモデル）」を公開した。分子の制約条件やスコアリング目標に基づき、新薬や酵素の候補となるタンパク質構造を自律生成できる。併せて、独Siemens Healthineersとの適応放射線治療におけるAI協業や、バイオ開発プラットフォーム「NVIDIA BioNeMo（創薬・生物学研究に特化した生成AI開発プラットフォーム）」を活用した科学エージェント群の進展も公表された。

ワシントン大学IPDとの共同開発「RFD4-Proteina」の性能と提供形態

RFD4-Proteinaは、生命活動を司るタンパク質の新たな設計案を探索・生成するためのBioNeMoオープンモデルだ。疾患の進行を抑制する結合タンパク質や、診断検査向けの標的検出タンパク質、農薬を分解する酵素などの設計を支援する。

研究論文ドラフトの評価試験において、RFD4-Proteinaは「タンパク質結合」「低分子結合」「酵素足場構造設計」「DNA結合」の4領域のベンチマークにおいて、既存ベースラインを上回る計算上の設計成功率と生成スループットを記録した。

2024年のノーベル化学賞受賞者であり、ワシントン大学IPD所長を務めるDavid Baker（デヴィッド・ベイカー）氏は、「私たちは自然が生み出したタンパク質を発見する時代から、まったく新しいタンパク質を設計できる時代へと移りつつある。モデルをオープンにすることで、世界中の研究者がかつては手の届かなかった課題の解決に取り組めるようになる」とコメントを寄せている。

本モデルは即日、Amazon Bio Discovery、AnthropicのClaude Science、Benchling、Google Cloud、Hugging Faceなどの主要パートナー基盤を通じて提供が開始されている。

Siemens Healthineersとの適応放射線治療協業

医療現場に向けた取り組みとして、Siemens Healthineersとの次世代適応放射線治療の開発協業が発表された。がん細胞に処方線量を正確に照射しつつ正常組織を保護する治療計画の立案において、AIエージェントとリアルタイム計算を融合させる。

• ​計画立案の自動化​: オープン基盤モデル「Nemotron（NVIDIAが開発するオープン基盤言語モデル群）」を活用したエージェントが、腫瘍医と協調して治療戦略を評価・調整
• ​高速シミュレーション​: CUDAによる線量計算の加速により、患者ごとの体内変化に合わせた即時シミュレーションを実現
• ​センサー連携​: 「NVIDIA Holoscan（医療・エッジ向けリアルタイムセンサー処理プラットフォーム）」を用いて治療機器のセンサーデータとAIを直結

BioNeMoを活用した科学エージェント開発事例

自律型実験室（セルフドライビングラボ）と創薬ワークフローを結合する各社の科学エージェント開発も加速している。

企業・パートナー	BioNeMoを活用した主な取り組み内容
Benchling	実験データと研究背景情報を統合し、科学エージェントの思考根拠として提供
Automata	自動化ラボの設備インフラとエージェントを接続し、自律的な実験実行とデータ取得を実現
Danaher (Genedata)	タンパク質設計ファウンドリ内でAI共同研究者が設計と試験を調整し、RFD4-Proteinaを次の設計サイクルへ反映
Hologen	医療大規模モデルとNemotronを組み合わせ、臨床試験の設計を支援する「AI臨床科学者」を構築

バイオインフォマティクスと医療DXへの展望

従来のバイオ研究では、計算機上の設計と実験室（ウェットラボ）での検証の間に長いタイムラグが存在していた。RFD4-Proteinaのようなオープンモデルと自律ラボ設備がエージェントを介して緊密にループを回すことで、創薬リードタイムの劇的な短縮が期待される。

さらに、オープンウェイトとしてモデルが広く無償公開されたことで、巨大製薬企業だけでなく学術機関や新興バイオベンチャーにも高度な設計機能が行き渡る意義は大きい。医療現場での放射線治療適応と合わせ、AIがライフサイエンスの実践基盤へと定着しつつある。

引用元：NVIDIA | Japan Blog